中国航运企业与世界其他航运企业相比，在税收、制度等方面不在同一个起跑线上。在我国，航运企业按3.5%缴纳营业税，按25%缴纳所得税，而欧美等国的航运企业既不缴纳营业税，也不缴纳所得税，而是采用税率很低的吨税。同时，我国对进口船舶及零件征收27.53%的关税，而发达国家的航运企业则免征。此外，我国对船员按累进所得征收所得税，而欧美等国对船员所得税予以抵免。这种不平衡使得我国的航运企业在与国外航运公司竞争时处于不利的地位。而在市场极为低迷的当下，政府似乎也有意暂时改善这一问题。有知情人士透露，交通部已经在和国家财政局就航运税收优惠进行沟通，可能会在全国范围内出台一些临时性的航运税收优惠政策，但这些措施是临时性的，主要是应对目前的低迷航运形势。